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Em 2012, São João da Boa Vista ganhou uma nova dimensão no mapa universitário brasileiro: a criação do campus da UNESP — Universidade Estadual Paulista — na cidade. O campus, chamado Mantiqueira, ampliou a oferta de ensino superior público na microrregião e marcou a chegada de uma universidade estadual a uma cidade que já tinha duas instituições particulares de ensino superior — UNIFEOB e UNIFAE — com décadas de atuação.
A UNESP em São João da Boa Vista integrou a cidade a uma rede universitária estadual que cobre todo o interior de São Paulo. Para os estudantes da microrregião — Aguaí, Águas da Prata, Espírito Santo do Pinhal, Santo Antônio do Jardim e municípios vizinhos —, o campus representa acesso à universidade pública sem necessidade de migrar para cidades maiores.
A história do campus ainda está sendo escrita. Um levantamento mais completo pode incluir os cursos oferecidos, o número de estudantes por ano, os projetos de pesquisa e extensão com impacto local, e os primeiros professores que construíram a instituição.