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O esporte é uma das formas mais fortes de pertencimento local. O Palmeiras Futebol Clube foi fundado em 12 de janeiro de 1924, na residência do capitão Manoel João Batista, no Largo das Palmeiras — hoje Praça Coronel José Pires. Alvinegro, inspirou-se nas cores da Associação Atlética das Palmeiras da capital. Teve 30 participações no Campeonato Paulista de Futebol. Em 5 de março de 1955 foi inaugurado o Estádio Getúlio Vargas Filho, com a presença do Guarani de Campinas.
A Sociedade Esportiva Sanjoanense tem mais de cem anos de história. O Reio/Sequóia/Time São João conquistou em 2024 o oitavo título da Taça EPTV de Futsal, vencendo Itirapina por 3 a 1, de virada, em São José do Rio Pardo, com campanha invicta de nove jogos e nove vitórias.
A história do esporte em São João inclui futebol, futsal, basquete, natação, vôlei, atletismo, jogos escolares e Jogos Regionais — e passa por clubes, ginásios, campos, torcidas, professores, atletas e famílias.
Fontes: O Município; Wikipedia (Palmeiras FC); Centro de Referência do Futebol Brasileiro. Estado: Palmeiras e Reio bem documentados; esporte em geral precisa de levantamento mais amplo.