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A UNESP em São João da Boa Vista deve ser entendida como a presença local da Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho” por meio da Faculdade de Engenharia de São João da Boa Vista, conhecida como FESJ. A unidade marcou uma nova etapa da educação superior pública na cidade, ampliando o eixo histórico de formação que já incluía instituições municipais, privadas e comunitárias.
Segundo a Fundunesp, o câmpus de São João da Boa Vista foi criado em 8 de março de 2012 por deliberação do Conselho Universitário da UNESP, no contexto de expansão do ensino superior público paulista, especialmente nas engenharias. A Agência FAPESP já noticiava, em novembro de 2012, a seleção de docentes para o curso de Engenharia de Telecomunicações no então campus experimental de São João da Boa Vista.
A Prefeitura Municipal registra que o câmpus foi criado em 2012, implantado em 2013 e passou a funcionar em prédio próprio em 2016, construído em terreno doado pelo município. Em 2022, a antiga unidade experimental foi consolidada como Faculdade de Engenharia do Câmpus de São João da Boa Vista, passando a ter estrutura administrativa e acadêmica própria dentro da UNESP.
A FESJ oferece cursos de graduação em Engenharia Aeronáutica e Engenharia Eletrônica e de Telecomunicações. Na pós-graduação, integra o Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica Interunidades ICTS/FESJ. Também aparece em projetos de pesquisa apoiados pela FAPESP nas áreas de aeronáutica, eletrônica e telecomunicações.
A relação entre UNESP, Campus Mantiqueira e Fazenda Escola é transversal: são partes do ecossistema regional de educação, ciência, tecnologia e inovação, articulado em eventos como o SECITEM. Campus Mantiqueira e Fazenda Escola pertencem ao ecossistema UNIFEOB, enquanto a UNESP local se refere à FESJ.